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类别Compare

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅类别Compare

使用特征注释对高通量实验的荟萃分析

生物导体版本:3.4

计算两个(或更多)特征(即基因)列表中的每个特征中的重要注释(类别),确定注释之间的重叠,并返回有关显着注释的图形和表格数据,以及特征的组合列表,注释被发现为注释。重要的。通过使用rcytoscape(大量建议)来促进交互式探索。

作者:Robert M. Flight

维护者:Robert M. Flight

引用(从r内,输入引用(“类别Compare”)):

安装

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文档

html R脚本 类别Compare:使用基因注释的高通量数据荟萃分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,途径,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 2.10),生物酶,,,,生物基因(> = 0.13.8)
进口 AnnotationDbi,,,,HWRITER,,,,gseabase,,,,类别(> = 2.33.1),gostats,,,,注释,,,,色彩空间,,,,图形,,,,rcytoscape(> = 1.5.11)
链接
建议 尼特, 方法,go.db,,,,kegg.db,,,,雌激素,,,,org.hs.eg.db,,,,HGU95AV2.DB,,,,林玛,,,,副词,,,,GeneFilter
系统要求 Cytoscape(> = 2.8.0)(如果用于可视化结果,则大量建议),Cytoscaperpc插件(> = 1.8)
增强
URL https://github.com/rmflight/categorycompare
BugReports https://github.com/rmflight/categorycompare/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 类别Compare_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/categorycompare/tree/release-3.4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/categorycompare/
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