要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("cellHTS2")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见cellHTS2.
Bioconductor版本:3.4
该试剂盒提供了在微滴板格式(包括但不限于384孔板)中进行高通量分析的工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制汇总和统计评分。生成一个网页,提供数据和分析结果的详细图形概述。在我们的工作中,我们已经将该包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选,以及酵母文库的筛选。参见cellHTS2的简要介绍。
作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber
维护者:约瑟夫·巴里<约瑟夫。巴瑞在宝莱坞
引用(来自R,输入引用(“cellHTS2”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("cellHTS2")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“cellHTS2”)
R脚本 | 主要插图(完整版):基于细胞的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 主要插图:基于细胞的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 补充:增强-抑制筛选 | |
R脚本 | 补充:多通道检测 | |
参考手册 |
biocViews | CellBasedAssays,预处理,软件,可视化 |
版本 | 2.38.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.1 (R-2.6)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),RColorBrewer,Biobase、方法、genefilter,splots,vsn,hwriter,locfit、网格 |
进口 | 普拉达,GSEABase,类别, stats4 |
链接 | |
建议 | ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber |
这取决于我 | coRNAi,imageHTS,staRank |
进口我 | gespeR,HTSanalyzeR,RNAinteract |
建议我 | bioassayR,普拉达 |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | cellHTS2_2.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | cellHTS2_2.38.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | cellHTS2_2.38.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/cellHTS2/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/cellHTS2/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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