要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" compepittools ")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见compEpiTools.
Bioconductor版本:3.4
计算表观基因组学工具用于分析、整合和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(epi)基因组学数据类型。
作者:Mattia Pelizzola, Kamal Kishore
维护者:卡迈勒·基肖尔<卡迈勒。Fartiyal84在gmail.com>
引用(来自R,输入引用(“compEpiTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" compepittools ")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“compEpiTools”)
R脚本 | compEpiTools.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,GeneExpression,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor中 | BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R(>= 3.1.1),方法;topGO,GenomicRanges |
进口 | AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,Rsamtools, parallel, grDevices,gplots,IRanges,GenomicFeatures,XVector,methylPipe,GO.db,S4Vectors,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,org.Mm.eg.db,knitr,rtracklayer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | compEpiTools_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | compEpiTools_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | compEpiTools_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/compEpiTools/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/compEpiTools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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