要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" compepittools ")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

compEpiTools

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见compEpiTools

计算表观基因组学工具

Bioconductor版本:3.4

计算表观基因组学工具用于分析、整合和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(epi)基因组学数据类型。

作者:Mattia Pelizzola, Kamal Kishore

维护者:卡迈勒·基肖尔<卡迈勒。Fartiyal84在gmail.com>

引用(来自R,输入引用(“compEpiTools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" compepittools ")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“compEpiTools”)

PDF R脚本 compEpiTools.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 报道GeneExpressionGenomeAnnotation测序软件可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor中 BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证 GPL
取决于 R(>= 3.1.1),方法;topGOGenomicRanges
进口 AnnotationDbiBiocGenericsBiostringsRsamtools, parallel, grDevices,gplotsIRangesGenomicFeaturesXVectormethylPipeGO.dbS4VectorsGenomeInfoDb
链接
建议 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGeneorg.Mm.eg.dbknitrrtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 compEpiTools_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 compEpiTools_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) compEpiTools_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/compEpiTools/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/compEpiTools/
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