要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ conumee”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Conumee

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Conumee

使用Illumina DNA甲基化阵列增强的拷贝数变化分析

生物导体版本:3.4

该软件包包含一组使用Illumina 450K或Epic甲基化阵列执行拷贝数变化(CNV)分析的处理和绘图方法。

作者:Marc Zapatka的Volker Hovestadt

维护者:Hovestadt.bio>的Volker Hovestadt

引用(从r内,输入引用(“ Conumee”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ conumee”)

文档

html R脚本 Conumee
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,DNAMETHYLATY,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0),Minfi,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,光照明甲基甲基化epicmanifest,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19
进口 方法,统计,DNACOPIGY,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GenomeInfodB
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Minfidata,,,,库务450KDATA,,,,rcurl
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Conumee_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 conumee_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) Conumee_1.8.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/conumee/tree/release-3.4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/conumee/
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