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diffHic
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅diffHic。
微分Analyis高c数据
Bioconductor版本:3.4
检测差高c实验在生物条件的交互。方法是提供校准和数据预处理解读交互项。统计分析是基于磨边机和支持标准化和过滤。几个可视化选项也可用。
作者:亚伦Lun <阿伦在wehi.edu.au >
维修工:亚伦Lun <阿伦在wehi.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“diffHic”)):
安装
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文档
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browseVignettes (“diffHic”)
| diffHic装饰图案 | ||
| diffHicUsersGuide.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,聚类,报道,嗝,MultipleComparison,归一化,预处理,测序,软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),GenomicRanges,InteractionSet,SummarizedExperiment |
| 进口 | Rsamtools,Rhtslib,Biostrings,BSgenome,rhdf5,刨边机,limma,csaw,locfit、方法、IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb,BiocGenerics、grDevices图形、属性、跑龙套 |
| 链接 | Rhtslib,zlibbioc |
| 建议 | BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805,矩阵 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | diffHic_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | diffHic_1.6.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.9(小牛) | diffHic_1.6.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/diffhic/tree/release - 3.4 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/diffHic/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
