要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ diffloop”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅diffloop。
生物导体版本:3.4
一套用于子集,可视化,注释和统计学的工具,分析一个或多个CHIA-PET实验的结果或推断染色质环的其他测定法。
作者:Caleb Lareau [AUT,CRE],Martin Aryee [AUT]
维护者:Caleb lareau
引用(从r内,输入引用(“ diffloop”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ diffloop”)
html | R脚本 | Diffloop:从染色质拓扑数据中识别差异DNA回路。 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,去,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | |
进口 | 方法,基因组机,,,,foreach,,,,plyr,,,,dplyr,,,,RESHAPE2,,,,GGPLOT2,,,,矩阵,,,,寿司,,,,EDGER,,,,Locfit,,,,Statmod,,,,Biomart,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,iranges,grdevices,图形,统计,utils,生物酶,,,,readr,,,,Data.Table,,,,rtracklayer,,,,pbapply,,,,林玛 |
链接 | |
建议 | deseq2,,,,diffloopdata,,,,Ggrepel,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/aryeelab/diffloop |
BugReports | https://github.com/aryeelab/diffloop/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | diffloop_1.2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | diffloop_1.2.2.2.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | diffloop_1.2.2.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/diffloop/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/diffloop/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |