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diffloop

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅diffloop

从染色质拓扑数据中识别差异DNA回路

生物导体版本:3.4

一套用于子集,可视化,注释和统计学的工具,分析一个或多个CHIA-PET实验的结果或推断染色质环的其他测定法。

作者:Caleb Lareau [AUT,CRE],Martin Aryee [AUT]

维护者:Caleb lareau

引用(从r内,输入引用(“ diffloop”)):

安装

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文档

html R脚本 Diffloop:从染色质拓扑数据中识别差异DNA回路。
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.2
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看
进口 方法,基因组机,,,,foreach,,,,plyr,,,,dplyr,,,,RESHAPE2,,,,GGPLOT2,,,,矩阵,,,,寿司,,,,EDGER,,,,Locfit,,,,Statmod,,,,Biomart,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,iranges,grdevices,图形,统计,utils,生物酶,,,,readr,,,,Data.Table,,,,rtracklayer,,,,pbapply,,,,林玛
链接
建议 deseq2,,,,diffloopdata,,,,Ggrepel,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/aryeelab/diffloop
BugReports https://github.com/aryeelab/diffloop/issues
取决于我
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包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 diffloop_1.2.2.2.tar.gz
Windows二进制 diffloop_1.2.2.2.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) diffloop_1.2.2.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/diffloop/tree/release-3.4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/diffloop/
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