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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅EasyRnaseq。

RNA-SEQ数据的计数摘要和归一化

生物导体版本：3.4

计算高通量短阅读对参考基因组的覆盖范围，并根据感兴趣的特征总结其（例如外显子，基因，转录本）。数据可以标准化为“ RPKM”或“ DESEQ”或“ EDGER”软件包。

作者：Nicolas Delhomme，Ismael Padioleau，Bastian Schiffthaler，Niklas Maehler

维护者：umu.se>> nicolas delhomme

安装

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文档

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browsevignettes（“ easyrnaseq”）

PDF	R脚本	EasyRnaseq
html	R脚本	Genenetworkr
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，遗传学，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，软件
版本	2.10.0
在生物导体中	Bioc 2.10（R-2.15）（5年）
执照	艺术2.0
要看
进口	生物酶（> = 2.31.3），生物基因（> = 0.17.2），生物比较（> = 1.5.1），Biomart（> = 2.27.2），生物弦（> = 2.39.3），deseq（> = 1.23.0），EDGER（> = 3.13.4），GenomeInfodB（> = 1.7.3），基因组合（> = 1.27.0），基因组签名（> = 1.7.3），基因组机（> = 1.23.16），总结性特征（> = 1.1.11），图形，iranges（> = 2.5.27），LSD（> = 3.0），Locfit，方法，并行，rsamtools（> = 1.23.1），S4VECTORS（> = 0.9.38），Shortread（> = 1.29.1），UTILS
链接
建议	生物使用（> = 1.9.2），BSGENOME（> = 1.39.0），bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3（> = 1.4.0），卷曲，，，，GenomicFeatures（> = 1.23.15），尼特，，，，rmarkDown，，，，rnaseqtutorial（> = 0.9.0），运行（> = 0.4.31）
系统要求
增强
URL
取决于我	rnaseqtutorial
进口我
建议我	seqgsea
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	easyrnaseq_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	easyrnaseq_2.10.0.zip
Mac OS X 10.9（Mavericks）	easyrnaseq_2.10.0.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/easyrnaseq/tree/release-3.4
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/easyrnaseq/
软件包下载报告	下载统计