要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("hopach")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

hopach

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见hopach

分层有序分区和压缩混合(HOPACH)

Bioconductor版本:3.4

HOPACH聚类算法通过递归地对数据集进行分区,同时在每个级别对聚类进行排序和可能的折叠,从而构建聚类的分层树。该算法使用均值/中位数分割轮廓(MSS)标准来识别具有最大同质簇的树的水平。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数自举允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。

作者:Katherine S. Pollard, Mark J. van der Laan (Laan at stat.berkeley.edu>)和Greg Wall

维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard网址:gladstone。ucsf.edu b>

引用(来自R,输入引用(“hopach”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("hopach")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“hopach”)

PDF R脚本 hopach
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类软件
版本 2.34.0
在Bioconductor中 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 12年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.11.0),集群Biobase、方法
进口 图形,grDevices,统计,utils,BiocGenerics
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/
这取决于我
进口我 phenoTest
建议我 BiocCaseStudies
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 hopach_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 hopach_2.34.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) hopach_2.34.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/hopach/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/hopach/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: