要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("hopach")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见hopach。
Bioconductor版本:3.4
HOPACH聚类算法通过递归地对数据集进行分区,同时在每个级别对聚类进行排序和可能的折叠,从而构建聚类的分层树。该算法使用均值/中位数分割轮廓(MSS)标准来识别具有最大同质簇的树的水平。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数自举允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。
作者:Katherine S. Pollard, Mark J. van der Laan (Laan at stat.berkeley.edu>)和Greg Wall
维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard网址:gladstone。ucsf.edu b>
引用(来自R,输入引用(“hopach”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("hopach")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“hopach”)
R脚本 | hopach | |
参考手册 |
biocViews | 聚类,软件 |
版本 | 2.34.0 |
在Bioconductor中 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 12年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.11.0),集群,Biobase、方法 |
进口 | 图形,grDevices,统计,utils,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/ |
这取决于我 | |
进口我 | phenoTest |
建议我 | BiocCaseStudies |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | hopach_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | hopach_2.34.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | hopach_2.34.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/hopach/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/hopach/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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