要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("limma")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

limma

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见limma

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:3.4

数据分析,线性模型和微阵列数据的差分表达。

作者:戈登·史密斯[中文,中文],胡一芳[中文],马修·里奇[中文],杰里米·西尔弗[中文],詹姆斯·韦滕霍尔[中文],戴维斯·麦卡锡[中文],吴迪[中文],石伟[中文],贝琳达·菲普森[中文],艾伦·伦[中文],娜塔莉·索恩[中文],Alicia Oshlack[中文],卡罗琳·德·格拉夫[中文],陈云顺[中文],Mette Langaas[中文],Egil Ferkingstad[中文],马库斯·戴维[中文],弗朗索瓦·佩平[中文],蔡东硕[中文]

维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“limma”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("limma")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“limma”)

PDF 一页介绍
PDF usersguide.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingBatchEffect贝叶斯聚类DataImportDifferentialExpressionDifferentialSplicingExonArrayGeneExpressionGeneSetEnrichment遗传学微阵列MultipleComparison归一化OneChannel预处理ProprietaryPlatforms质量控制RNASeq回归软件TimeCourse转录TwoChannelmRNAMicroarraymicroRNAArray
版本 3.30.13
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 12年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.3.0)
进口 设备,图形,统计,utils,方法
链接
建议 affyAnnotationDbiBiasedUrnBiobase椭圆GO.dbgplotsilluminaiolocfit质量org.Hs.eg.db样条函数,statmod(> = 1.2.2),vsn
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
全靠我 a4BaseAffyExpressAgiMicroRnabirtabsseqCALIB亚兰cghMCRChimpHumanBrainDataclippdacodelink转换CormotifcoRNAiDrugVsDisease刨边机ExiMiRExpressionAtlas有限元法Fletcher2013agCMAPgenefuHD2013SGIHTqPCRmaigesPackmaPredictDSCmarraymetagenomeSeqmetaseqRMLSeqMmPalateMiRNAPGPCprot2DqpcrNormqusage遏制林格RnBeadsRnitssnapCGHsplineTimeRSRGnetSSPAtRanslatomeTurboNorm西瓜
进口我 ABSSeqaffycoretoolsaffylmGUIanamiRArrayExpressarrayQualityarrayQualityMetricsArrayTools吸引舞会礼服BatchQCbeadarrayBeadArrayUseCasesbetrbirteBubbleTreebumphunterCALIBCancerMutationAnalysisCancerSubtypes卡斯珀冠军魅力ChIPCompChIPpeakAnnoclusterExperimentcompcodeR承认CountClustcrlmmcrossmetacsawctsGEDAPARdebrowserderfinderPlotDEsubsDiffBinddiffHicdiffloopDmelSGIDMRcateEBSEAeegc天哪EGSEAEnrichmentBrowsererccdashboardexploraseflowBingCrisprToolsGeneSelectMMDGeneSelectorGGBaseGOsummariesgQTLstatsGUIDEseqHTqPCRiCheckiChipiCOBRAInPASlimmaGUILinnormlmdmeLVSmiRNAmAPKLmethylKitMethylMixminfimiRLABmissMethylMmPalateMiRNA单片眼镜MoonlightRMSstatsnemnethetnondetectsOGSA奥林PAAPADOGPathoStatpbcmcpcaExplorerPECApepStatphenoTest聚酯qsearCGHregspliceReportingTools林格RNAinteractRNAitherRTCGAToolbox研制RToppersigaRSimBindProfilessnapCGHSTATegRaSVAPLSseqsystemPipeRTCGAbiolinkstimecourseToPASeq泛太平洋伙伴关系tweeDEseqvariancePartitionvsn山药
建议我 ABarrayADaCGH2beadarraySNPbiobroomBiocCaseStudies生命网络类别categoryCompareClassifyRCMAcoGPSderfinderdyebiasGeneSelectorGEOqueryGeuvadisTranscriptExprGlimmaGSRIGSVA哈曼Heatplus等压线莱斯光民mammaPrintData桅杆mdgsamethylumi中长期规划npGSEA益生元oneChannelGUIopparpaxtoolsrPGSEA钢琴plwPREDA彪马RcadeRTopperrtracklayer食物seventyGeneDatasubSeq股东价值分析tximport
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 limma_3.30.13.tar.gz
Windows二进制 limma_3.30.13.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) limma_3.30.13.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/limma/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/limma/
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