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在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Lumi。
生物导体版本:3.4
Lumi软件包为Illumina微阵列数据分析提供了集成解决方案。它包括Illumina beadstudio(Genomestudio)数据输入,质量控制,Beadarray特异性方差稳定,归一化和基因注释在探针水平上的功能。它还包括处理Illumina甲基化微阵列的功能,尤其是Illumina Infinium甲基化微阵列。
作者:Pan Du,Richard Bourgon,Gang Feng,Simon Lin
维护者:pan du
引用(从r内,输入引用(“ Lumi”)
):
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参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 2.26.4 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(10年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.10),生物酶(> = 2.5.5) |
进口 | 副词(> = 1.23.4),甲基菌(> = 2.3.2),GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,注释,,,,格子,,,,MGCV(> = 1.4-0),nleqslv,,,,克恩斯门茶,,,,预处理,,,,rsqlite,,,,DBI,,,,AnnotationDbi,,,,大量的,图形,统计,统计4,方法 |
链接 | |
建议 | Beadarray,,,,林玛,,,,VSN,,,,Lumibarnes,,,,Lumihumanall.db,,,,Lumhumanidmapping,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | arraymvout,,,,ffpeexampledata,,,,Icheck,,,,Lumibarnes,,,,Lumhumanidmapping,,,,LumimouseIdMapping,,,,LumiratidMapping,,,,maqcsubset,,,,maqcsubsetilm,,,,mvoutdata,,,,西瓜 |
进口我 | 阿纳米尔,,,,FFPE,,,,甲基分析,,,,米尼卡 |
建议我 | Beadarray,,,,Blima,,,,哈曼,,,,甲基菌,,,,蒂格 |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | lumi_2.26.4.tar.gz |
Windows二进制 | lumi_2.26.4.4 zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | lumi_2.26.4.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/lumi/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/lumi/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |