要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“pRoloc”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

pRoloc

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见pRoloc

空间蛋白质组学统一的生物信息学框架

Bioconductor版本:3.4

该软件包实现了定量质谱数据的模式识别技术,以推断蛋白质亚细胞定位。

作者:劳伦特·盖托和丽莎·m·布雷克尔斯,托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克撰稿

维护者:Laurent Gatto

引文(从R内,输入引用(“pRoloc”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“pRoloc”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“pRoloc”)

PDF R脚本 空间蛋白质组学的迁移学习算法
PDF R脚本 HUPO 2011海报:pRoloc——统一的细胞器蛋白质组学生物信息学框架
PDF R脚本 HUPO 2014海报:用于空间蛋白质组学数据分析的最先进的机器学习管道
PDF pRoloc中提供的机器学习技术
PDF pRoloc教程
超文本标记语言 R脚本 注释空间蛋白质组数据
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻
视频 pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI

细节

biocViews 分类聚类MassSpectrometry蛋白质组学质量控制软件
版本 1.14.6
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(4年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.15),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.37.1),方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel
进口 Biobasemclust(> = 4.3),脱字符号e1071抽样kernlab晶格nnetrandomForest代理模糊神经网络BiocGenerics统计数据,dendextendRColorBrewer尺度质量knitrmvtnormgtoolsplyrggplot2biomaRt, utils, grDevices,图形
链接 RcppRcppArmadillo
建议 testthatrmarkdownpRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2synapterxtabletsnehexbinrglBiocStylehpar(> = 1.15.3),dplyrGO.dbAnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lgatto/pRoloc
BugReports https://github.com/lgatto/pRoloc/issues
全靠我 pRolocGUI
进口我
建议我 MSnbasepRolocdataRforProteomics
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 pRoloc_1.14.6.tar.gz
Windows二进制 pRoloc_1.14.6.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) pRoloc_1.14.6.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/pRoloc/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pRoloc/
软件包下载报告 下载数据

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