要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“pRoloc”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见pRoloc.
Bioconductor版本:3.4
该软件包实现了定量质谱数据的模式识别技术,以推断蛋白质亚细胞定位。
作者:劳伦特·盖托和丽莎·m·布雷克尔斯,托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克撰稿
维护者:Laurent Gatto
引文(从R内,输入引用(“pRoloc”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“pRoloc”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“pRoloc”)
R脚本 | 空间蛋白质组学的迁移学习算法 | |
R脚本 | HUPO 2011海报:pRoloc——统一的细胞器蛋白质组学生物信息学框架 | |
R脚本 | HUPO 2014海报:用于空间蛋白质组学数据分析的最先进的机器学习管道 | |
pRoloc中提供的机器学习技术 | ||
pRoloc教程 | ||
超文本标记语言 | R脚本 | 注释空间蛋白质组数据 |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 | |
视频 | pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI |
biocViews | 分类,聚类,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.14.6 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(4年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.15),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.37.1),方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel |
进口 | Biobase,mclust(> = 4.3),脱字符号,e1071,抽样,类,kernlab,晶格,nnet,randomForest,代理,模糊神经网络,BiocGenerics统计数据,dendextend,RColorBrewer,尺度,质量,knitr,mvtnorm,gtools,plyr,ggplot2,biomaRt, utils, grDevices,图形 |
链接 | Rcpp,RcppArmadillo |
建议 | testthat,rmarkdown,pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,synapter,xtable,tsne,hexbin,rgl,BiocStyle,hpar(> = 1.15.3),dplyr,GO.db,AnnotationDbi |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/pRoloc |
BugReports | https://github.com/lgatto/pRoloc/issues |
全靠我 | pRolocGUI |
进口我 | |
建议我 | MSnbase,pRolocdata,RforProteomics |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | pRoloc_1.14.6.tar.gz |
Windows二进制 | pRoloc_1.14.6.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | pRoloc_1.14.6.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/pRoloc/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pRoloc/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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