要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“表型测试”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见phenoTest.
Bioconductor版本:3.4
以高效、结构化、快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供了GSEA。
作者:evalist Planet
维护者:evalist行星< evalist。行星在epfl.ch>
引文(从R内,输入引用(“phenoTest”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“表型测试”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“phenoTest”)
R脚本 | phenoTest库手册 | |
参考手册 |
biocViews | 分类,聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.23.1 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(6年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 2.12.0),Biobase、方法、注释,Heatplus,BMA,ggplot2 |
进口 | 生存,limma,Hmisc,gplots,类别,AnnotationDbi,hopach,biomaRt,GSEABase,genefilter,xtable,注释,mgcv,SNPchip,hgu133a.db,HTSanalyzeR,椭圆 |
链接 | |
建议 | GSEABase,KEGG.db,GO.db |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行,org.Ce.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Dm.eg.db |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | 癌症 |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | phenoTest_1.23.1.tar.gz |
Windows二进制 | phenoTest_1.23.1.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | phenoTest_1.23.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/phenoTest/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/phenoTest/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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