要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“表型测试”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

phenoTest

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见phenoTest

以高效、结构化、快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间关联的工具。我们也提供工具做GSEA(基因集富集分析)和拷贝数变异。

Bioconductor版本:3.4

以高效、结构化、快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供了GSEA。

作者:evalist Planet

维护者:evalist行星< evalist。行星在epfl.ch>

引文(从R内,输入引用(“phenoTest”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“表型测试”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“phenoTest”)

PDF R脚本 phenoTest库手册
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类聚类DifferentialExpression微阵列MultipleComparison软件
版本 1.23.1
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.12.0),Biobase、方法、注释HeatplusBMAggplot2
进口 生存limmaHmiscgplots类别AnnotationDbihopachbiomaRtGSEABasegenefilterxtable注释mgcvSNPchiphgu133a.dbHTSanalyzeR椭圆
链接
建议 GSEABaseKEGG.dbGO.db
SystemRequirements
增强了 平行,org.Ce.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Hs.eg.dborg.Dm.eg.db
URL
全靠我
进口我 癌症
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 phenoTest_1.23.1.tar.gz
Windows二进制 phenoTest_1.23.1.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) phenoTest_1.23.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/phenoTest/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/phenoTest/
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