要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ splicer”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅拼接器。
生物导体版本:3.4
用于分类的替代剪接和从RNA-seq数据进行编码潜力预测的R软件包。
作者:johannes waage
维护者:johannes waage
引用(从r内,输入引用(“拼接”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ splicer”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“拼接”)
R脚本 | 拼接数小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(3。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.15.0),方法,腹带,,,,rtracklayer,,,,Venndiagram,,,,rcolorbrewer,,,,plyr |
进口 | 基因组机,,,,iranges |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Splicer_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | Splicer_1.16.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Splicer_1.16.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/splicer/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/splicer/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |