要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ tximport”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

tximport

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅tximport

导入和总结基因级分析的成绩单级估计值

生物导体版本:3.4

进口笔录级丰度,估计计数和转录本长度,并将其汇总到矩阵中,以与下游基因级分析软件包一起使用。通过样品特异性转录物丰度估计加权的平均转录本长度作为矩阵提供,可用作基因级数不同表达的偏移。

作者:迈克尔·洛夫(Michael Love),夏洛特·索恩森(Charlotte Soneson),马克·罗宾逊(Mark Robinson)

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“ tximport”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ tximport”)

文档

html R脚本 tximport
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口 UTILS
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,tximportdata,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,readr(> = 0.2.2),林玛,,,,EDGER,,,,deseq2(> = 1.11.6)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 评分
建议我 deseq2,,,,方差分区
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 tximport_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 tximport_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) tximport_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/tximport/tree/release-3.4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tximport/
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