### R代码从vignette源的LVSmiRNA。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:负载。自由 ################################################### 库(LVSmiRNA ) ################################################### ### 代码块2号:导入 ################################################### dir。文件<- system。taqman. file("extdata", package="LVSmiRNA")数据< - read.table (file.path (dir.files Comparison_Array.txt),头= TRUE,人群收税= TRUE ) ################################################### ### 代码块3号:阅读。米尔(eval = FALSE ) ################################################### ## ## 在这里。文件< -“一些/道路/ /文件”# # # #没有运行# #米尔< - read.mir (taqman.data、路径= here.files ) ## ################################################### ### 代码块数量4:负载 ################################################### 数据(“MIR-spike-in ") ################################################### ### 代码块5号:estVC ################################################### 米尔。RA < - estVC(米尔 ) ################################################### ### 代码块6号:米尔。类风湿性关节炎 ################################################### 数据(“MIR_RA ") ################################################### ### 代码块7号:情节 ################################################### 情节(MIR.RA ) ################################################### ### 代码块8号:lv ################################################### 米尔。lv < - lv(米尔,RA = MIR.RA ) ################################################### ### 代码块9号:箱线图 ################################################### 箱线图(MIR.lvs ) ################################################### ### 代码块10号:总结 ################################################### 例1 < -总结(米尔,RA = MIR.RA方法=“那么使用rlm”)例2 < -总结(米尔、方法= " medianpolish ") ################################################### ### 代码块11号:多核(eval = FALSE ) ################################################### ## ## 要求(多核)# #选项(核心= 8)# # # #米尔。RA < - estVC(米尔 ) ## ################################################### ### 代码块12号:雪(eval = FALSE ) ################################################### ## ## 要求(雪)# # cl < - makeCluster(8,“袜子”)# # # #米尔。RA <- estVC(MIR,clName=cl) ## ## stopCluster(cl) ## ################################################### ### code chunk number 13: mpi (eval = FALSE) ################################################### ## ## cl <- makeCluster(8,"MPI") ## ## MIR.RA <- estVC(MIR,clName=cl) ## ## stopCluster(cl) ##