### R代码从vignette源的traseR。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:风格 ################################################### BiocStyle::乳胶(use.unsrturl = FALSE ) ################################################### ### 代码块2号:tra利用。Rnw: 112 - 114 (eval = FALSE ) ################################################### ## x = tra利用(snpdb = taSNP地区= Tcell) # #打印(x ) ################################################### ### 代码块3号:tra利用。Rnw: 117 - 119 (eval = FALSE ) ################################################### ## x = tra利用(snpdb = taSNPLD地区= Tcell) # #打印(x ) ################################################### ### 代码块数量4:tra利用。Rnw: 122 - 123 (eval = FALSE ) ################################################### ## x = tra利用(snpdb = taSNP、地区= Tcell snpdb.bg = CEU ) ################################################### ### 代码块5号:tra利用。Rnw: 150 - 155 ################################################### 图书馆(tra利用)的数据(taSNP)数据(Tcell) x = tra利用(taSNP Tcell)打印(x ) ################################################### ### 代码块6号:tra利用。Rnw: 161 - 162 ################################################### plotContext (snpdb = taSNP、地区= Tcell,关键字= "自身免疫性 ") ################################################### ### 代码块7号:tra利用。Rnw: 172 - 173 ################################################### plotPvalue (snpdb = taSNP、地区= Tcell,关键字=“免疫性”,plot.type = " densityplot ") ################################################### ### 代码块8号:tra利用。Rnw: 183 - 184 ################################################### plotInterval (snpdb = taSNP data.frame(=“chrX”,从而向开始= 152633780 = 152737085 )) ################################################### ### 代码块9号:tra利用。Rnw: 194 - 196 ################################################### x = queryKeyword (snpdb = taSNP、地区= Tcell,关键字=“免疫性”,returnby = SNP)头(x ) ################################################### ### 代码块10号:tra利用。Rnw: 201 - 203 ################################################### x = queryGene (snpdb = taSNP基因= c(“AGRN”、“UBE2J2”,“SSU72”))x ################################################### ### 代码块11号:tra利用。Rnw: 208 - 210 ################################################### x = querySNP (snpdb = taSNP snpid = c(“rs3766178”、“rs880051”))x ################################################### ### 代码块12号:tra利用。Rnw: 219 - 220 ################################################### sessionInfo ()