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帕西拉

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅帕西拉

Brooks等人的Pasilla敲除RNA-SEQ样品的数据包和人均读数,2011年基因组研究。

生物导体版本:3.4

该软件包提供了从RNA-seq数据中计算出的每个基因的每个读取计数,这些数据是在文章中介绍的,这些数据是“果蝇和哺乳动物之间RNA调节图的保存”,Brooks An,Yang L,Duff MO,Hansen,HansenKD,Park JW,Dudoit S,Brenner SE,Graveley BR,Genome Res。2011年2月; 21(2):193-202,Epub 2010年10月4日,PMID:20921232。实验研究了pasilla的RNAi敲低的影响,果蝇果蝇的哺乳动物Nova1和Nova2的果蝇直系同源物对转录组。软件包小插图描述了此处提供的数据是如何从rna-seq读取序列数据中得出的,这些序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176到GSM461181提供。

作者:沃尔夫冈·胡伯(Alejandro Reyes)

维护者:Alejandro Reyes

引用(从r内,输入引用(“ pasilla”)):

安装

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文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 Drosophila_melanogaster_data,,,,实验数据,,,,基因组,,,,rnaseqdata
版本 1.2.0
执照 LGPL
要看 r(> = 3.3.0)
进口
链接
建议 dexseq,,,,rmarkDown
系统要求
增强
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进口我
建议我 坏人,,,,deseq,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,GeneFilter,,,,基因组机,,,,ihwpaper,,,,pasillabamsubset,,,,地区报告,,,,报告工具
构建报告

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包源 pasilla_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(Mavericks)
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