要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pasilla”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅帕西拉。
生物导体版本:3.4
该软件包提供了从RNA-seq数据中计算出的每个基因的每个读取计数,这些数据是在文章中介绍的,这些数据是“果蝇和哺乳动物之间RNA调节图的保存”,Brooks An,Yang L,Duff MO,Hansen,HansenKD,Park JW,Dudoit S,Brenner SE,Graveley BR,Genome Res。2011年2月; 21(2):193-202,Epub 2010年10月4日,PMID:20921232。实验研究了pasilla的RNAi敲低的影响,果蝇果蝇的哺乳动物Nova1和Nova2的果蝇直系同源物对转录组。软件包小插图描述了此处提供的数据是如何从rna-seq读取序列数据中得出的,这些序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176到GSM461181提供。
作者:沃尔夫冈·胡伯(Alejandro Reyes)
维护者:Alejandro Reyes
引用(从r内,输入引用(“ pasilla”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pasilla”)
参考手册 |
生物浏览 | Drosophila_melanogaster_data,,,,实验数据,,,,基因组,,,,rnaseqdata |
版本 | 1.2.0 |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 3.3.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | dexseq,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 坏人,,,,deseq,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,GeneFilter,,,,基因组机,,,,ihwpaper,,,,pasillabamsubset,,,,地区报告,,,,报告工具 |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | pasilla_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pasilla/ |
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