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DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocGenerics

S4 Bioconductor通用功能

Bioconductor版本:Release (3.5)

许多Bioconductor软件包所需的S4通用功能。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	0.22.1
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法，utils，图形，统计，并行
进口	方法，utils，图形，统计，并行
链接
建议	Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，AnnotationDbi，oligoClasses，益生元，affyPLM，flowClust，affy，DESeq2，MSnbase，注释，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ACME，affy，affyPLM，altcdfenvs，AnnotationDbi，AnnotationForge，AnnotationHub，ATACseqQC，beadarray，bioassayR，Biobase，Biostrings，BSgenome，bsseq，红衣主教，类别，categoryCompare，ChAMPdata，chipseq，ChIPseqR，ChromHeatMap，cleanUpdTSeq，codelink，consensusSeekeR，copynumber，CRISPRseek，腰带，DelayedArray，DESeq，dexus，ensembldb，ensemblVEP，ExperimentHub，ExperimentHubData，有限元法，flowQ，geneplotter，GenomeInfoDb，genomeIntervals，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicRanges，GenomicScores，Genominator，genoset，ggbio，girafe，图，GRridge，GSEABase，GUIDEseq，HelloRanges，htSeqTools，interactiveDisplay，interactiveDisplayBase，IRanges，工商管理硕士，MeSHDbi，meshr，methyAnalysis，MIGSA，MineICA，minfi，MLInterfaces，MotifDb，MotIV，MSnbase，乘，NADfinder，益生元，OrganismDbi，pandaR，Pbase，图片，plethy，PSICQUIC，PWMEnrich，RareVariantVis，REDseq，Repitools，rMAT，RNAprobR，RnBeads，战，rsbml，S4Vectors，scsR，shinyMethyl，ShortRead，simpleaffy，simulatorZ，soGGi，TEQC，tigre，topGO，撤销，UniProt.ws，VanillaICE，VariantAnnotation，VariantFiltering，XVector，山药
进口我	affycoretools，affylmGUI，AllelicImbalance，AneuFinder，annmap，注释，AnnotationDbi，AnnotationHubData，ArrayExpressHTS，ASpli，bamsignals，biocGraph，biosvd，biovizBase，BiSeq，blima，BrowserViz，BrowserVizDemo，BSgenome，BubbleTree，bumphunter，卡斯珀，cellHTS2，cgdv17，cghMCR，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPpeakAnno，ChIPQC，ChIPseeker，chipseq，clusterSeq，cn.mops，cn，CNPBayes，cobindR，compEpiTools，crlmm，crossmeta，csaw，腰带，curatedCRCData，curatedOvarianData，ddCt，DESeq2，命运，DEXSeq，diffHic，DirichletMultinomial，DOQTL，DRIMSeq，DrugVsDisease，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，eiR，eisa，埃尔默，epigenomix，epivizrStandalone，erma，FamAgg，fastseg，ffpe，FindMyFriends，flowBin，flowClust，flowCore，flowFP，flowQ，FlowSOM，flowStats，flowWorkspace，fmcsR，frma，FunciSNP，GA4GHclient，gcapc，gCMAPWeb，genbankr，geneAttribution，geneClassifiers，《创世纪》，GenomicAlignments，GenomicInteractions，GenomicTuples，genotypeeval，GenVisR，GGBase，GGtools，goseq，哥特，gQTLBase，gQTLstats，GSVA，Gviz，gwascat，HDF5Array，的热图，hiReadsProcessor，hopach，HTSeqGenie，IHW，IHWpaper，ima，检查，intansv，InteractionSet，感兴趣，电离，isomiRs，iva，JunctionSeq，KCsmart，KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO，KEGGdzPathwaysGEO，萝拉，LVSmiRNA，M3D，桅杆，事，餐，metaMS，MethylAid，methylPipe，methylumi，mimager，MinimumDistance，海市蜃楼，mogsa，单片眼镜，motifbreakR，msa，MultiAssayExperiment，MultiDataSet，MutationalPatterns，mzR，NarrowPeaks，ncdfFlow，npGSEA，诊断，oligoClasses，parglms，pbcmc，pcaMethods，pdInfoBuilder，phyloseq，钢琴，平，赢钱，podkat，普拉达，ProCoNA，profileScoreDist，pRoloc，pwOmics，qsea，QuasR，R3CPET，R453Plus1Toolbox，RaggedExperiment，ramwas，美国广播公司，RCyjs，RCytoscape，收回，REDseq，RefNet，REMP，ReportingTools，RGalaxy，RGSEA，RiboProfiling，林格，RJMCMCNucleosomes，rMAT，咆哮，Rqc，rqubic，Rsamtools，rsbml，rtracklayer，S4Vectors，嘘，SGSeq，签名者，simpleaffy，SLGI，SNPhood，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38，snpStats，spliceSites，SplicingGraphs，sscu，斯坦，彩带，SummarizedExperiment，systemPipeR，systemPipeRdata，TarSeqQC，TCseq，TFBSTools，transcriptR，TransView，triform，TSRchitect，TSSi，TVTB，unifiedWMWqPCR，的作用，VariantTools，VariantToolsData，wavClusteR，xcms，XDE，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，XVector
建议我	acde，目标，ArrayTV，资产，BaalChIP，baySeq，bigmelon，bigmemoryExtras，BiocCheck，BiocInstaller，BiocParallel，BiocStyle，biocViews，BioMedR，biosigner，BiRewire，BLMA，咖啡馆，相机，CancerSubtypes，萤石，CausalR，ccrepe，CellNOptR，CexoR，ChIPXpress，CHRONOS，CINdex，限幅器，clonotypeR，clustComp，CNORfeeder，CNORfuzzy，CNVPanelizer，彗星，ConnectivityMap，cosmiq，COSNet，cpvSNP，cydar，cytofkit，DAPAR，DBChIP，DEGreport，DEsubs，DMRcaller，DMRcate，ENCODExplorer，ENmix，epiNEM，EventPointer，fCCAC，FGNet，flowCL，flowQB，FlowRepositoryR，flowTime，focalCall，gCMAP，gCrisprTools，gdsfmt，宝石，基因。E，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，geneRxCluster，geNetClassifier，genomation，GEOquery，GMRP，GOstats，GraphPAC，GreyListChIP，grndata，GWASTools，h5vc，哈曼，HarmanData，hiAnnotator，hierGWAS，超图，iCARE，iClusterPlus，illuminaio，InPAS，INPower，首次公开募股，烤肉串，KEGGREST，ldblock，林肯，mAPKL，massiR，MatrixRider，mbt，mdgsa，Mergeomics，MeSH.Aca.eg.db，MeSH.Aga.PEST.eg.db，MeSH.Ame.eg.db，MeSH.Aml.eg.db，MeSH.Ana.eg.db，MeSH.Ani.FGSC.eg.db，MeSH.AOR.db，MeSH.Ath.eg.db，MeSH.Atu.K84.eg.db，MeSH.Bfl.eg.db，MeSH.Bsu.168.eg.db，MeSH.Bsu.TUB10.eg.db，MeSH.Bta.eg.db，MeSH.Cal.SC5314.eg.db，MeSH.Cbr.eg.db，MeSH.Cel.eg.db，MeSH.Cfa.eg.db，MeSH.Cin.eg.db，MeSH.Cja.eg.db，MeSH.Cpo.eg.db，MeSH.Cre.eg.db，MeSH.Dan.eg.db，MeSH.db，MeSH.Dda.3937.eg.db，MeSH.Ddi.AX4.eg.db，MeSH.Der.eg.db，MeSH.Dgr.eg.db，MeSH.Dme.eg.db，MeSH.Dmo.eg.db，MeSH.Dpe.eg.db，MeSH.Dre.eg.db，MeSH.Dse.eg.db，MeSH.Dsi.eg.db，MeSH.Dvi.eg.db，MeSH.Dya.eg.db，MeSH.Eco.55989.eg.db，MeSH.Eco.ED1a.eg.db，MeSH.Eco.IAI39.eg.db，MeSH.Eco.K12.MG1655.eg.db，MeSH.Eco.O157.H7.Sakai.eg.db，MeSH.Eco.UMN026.eg.db，MeSH.Eqc.eg.db，MeSH.Gga.eg.db，MeSH.Gma.eg.db，MeSH.Hsa.eg.db，MeSH.Laf.eg.db，MeSH.Lma.eg.db，MeSH.Mdo.eg.db，MeSH.Mes.eg.db，MeSH.Mga.eg.db，MeSH.Miy.eg.db，MeSH.Mml.eg.db，MeSH.Mmu.eg.db，MeSH.Mtr.eg.db，MeSH.Nle.eg.db，MeSH.Oan.eg.db，MeSH.Ocu.eg.db，MeSH.Oni.eg.db，MeSH.Osa.eg.db，MeSH.Pab.eg.db，MeSH.Pae.PAO1.eg.db，MeSH.PCR.db，MeSH.Pfa.3D7.eg.db，MeSH.Pto.eg.db，MeSH.Ptr.eg.db，MeSH.Rno.eg.db，MeSH.Sce.S288c.eg.db，MeSH.Sco.A32.eg.db，MeSH.Sil.eg.db，MeSH.Spo.972h.eg.db，MeSH.Spu.eg.db，MeSH.Ssc.eg.db，MeSH.Syn.eg.db，MeSH.Tbr.9274.eg.db，MeSH.Tgo.ME49.eg.db，MeSH.Tgu.eg.db，MeSH.Vvi.eg.db，MeSH.Xla.eg.db，MeSH.Xtr.eg.db，MeSH.Zma.eg.db，金属底座，MetaboSignal，metagene，metagenomeSeq，metaseqR，MetCirc，methylInheritance，MIGSAdata，miRcomp，mirIntegrator，miRLAB，Mirsynergy，motifStack，MSnID，multiClust，MultiMed，multiOmicsViz，MWASTools，netbenchmark，netbiov，NetSAM，nondetects，nucleoSim，OncoScore，PAA，Path2PPI，PathNet，pathview，pepXMLTab，PGA，PhenStat，奖，proBAMr，proFIA，proteoQC，PureCN，qpgraph，quantro，QuartPAC，RBGL，rBiopaxParser，Rcade，rcellminer，rCGH，Rcpi，RCy3，RGraph2js，Rgraphviz，rgsepd，riboSeqR，ROntoTools，ropls，研制，RTNduals，rTRM，samExploreR，sangerseqR，圣诞老人，sapFinder，segmentSeq，SeqArray，seqPattern，seqTools，SeqVarTools，SICtools，sigsquared，SIMAT，similaRpeak，SIMLR，SNPRelate，SpacePAC，sparseDOSSA，specL，STATegRa，STRINGdb，移行细胞癌，锡，ToPASeq，trackViewer，tra利用，TRONCO，Uniquorn
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocGenerics_0.22.1.tar.gz
Windows二进制	BiocGenerics_0.22.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocGenerics_0.22.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocGenerics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocGenerics/
软件包下载报告	下载数据