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DOI:10.18129 / B9.bioc.CNVrd2

CNVrd2:一种基于读深的方法，用于从下一代测序数据中检测复杂的常见拷贝数变异并进行基因分型。

Bioconductor版本:Release (3.5)

CNVrd2利用下一代测序数据测量多个样本的人类基因拷贝数，识别标记拷贝数变体的snp，并检测拷贝数多态性基因组区域。

作者:黄檀阮，托尼R梅里曼和米克布莱克

维护:Hoang Tan Nguyen

安装

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文档

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PDF	R脚本	Markdown Vignette与针织
PDF		参考手册

细节

biocViews	集群。，CopyNumberVariation，报道，LinkageDisequilibrium，单核苷酸多态性，测序，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，VariantAnnotation平行,rjags，ggplot2，gridExtra
进口	DNAcopy，IRanges，Rsamtools
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hoangtn/CNVrd2
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CNVrd2_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	CNVrd2_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CNVrd2_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNVrd2
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CNVrd2/
软件包下载报告	下载数据