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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“CompGO”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
CompGO
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CompGO
R管道请全部文件注释,比较词浓缩之间基因集和数据可视化
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包包含函数来完成一些任务。它可以下载完整的从UCSC基因组数据库,导入请全部文件,标注这些轮回文件区域的基因从上述数据库转储(加上距离),界面与大卫创建功能注释和基因本体浓缩图表基于基因列表(比如从输入生成请全部文件)最后想象和比较这些充实使用有向无环图或散点图。
作者:山姆·d·巴塞特(aut),阿什利·j·Waardenberg (aut (cre)
维护人员:阿什利·j . Waardenberg <。在victorchang.edu.au Waardenberg >
从内部引用(R,回车引用(“CompGO”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“CompGO”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CompGO”)
| R脚本 | 介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 去,GeneSetEnrichment,MultipleComparison,软件,可视化 |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | RDAVIDWebService |
| 进口 | rtracklayer,Rgraphviz,ggplot2,GenomicFeatures,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,pcaMethods,reshape2,pathview |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CompGO_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CompGO_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | CompGO_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CompGO |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CompGO/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
