- 家
- Bioconductor 3.5
- 软件包
- 文案
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite(文案)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
文案
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.CopywriteR
从目标是使用不相干的读取的序列拷贝数信息
Bioconductor版本:版本(3.5)
文案中提取DNA拷贝数的信息有针对性的测序utiizing脱靶读取。它允许提取均匀分布拷贝数信息,可以使用没有参考,可以应用于测序数据来自各种技术包括基因染色质免疫沉淀反应和目标浓缩在小板。因此,文案构成广泛适用的选择可用的拷贝数检测工具。
作者:托马斯Kuilman
维护人员:托马斯Kuilman < t。在nki.nl kuilman >
从内部引用(R,回车引用(文案)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite(文案)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(文案)
| R脚本 | 文案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation,报道,ExomeSeq,预处理,软件,TargetedResequencing,可视化 |
| 版本 | 2.8.1发布 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.2),BiocParallel |
| 进口 | matrixStats,gtools,data.table,S4Vectors,chipseq,IRanges,Rsamtools,DNAcopy,GenomicAlignments,GenomicRanges,CopyhelpeR,GenomeInfoDb,futile.logger |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,SCLCBam,雪 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/PeeperLab/CopywriteR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CopywriteR_2.8.1.tar.gz |
| Windows二进制 | CopywriteR_2.8.1.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | CopywriteR_2.8.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopywriteR |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CopywriteR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
