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DNAcopy

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAcopy

DNA拷贝数的数据分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

实现了循环二进制分割(CBS)算法来段DNA拷贝数数据和识别基因组拷贝数异常的地区。

作者:万卡特拉曼·莱马克里斯·e·珊,亚当Olshen

维修工:万卡特拉曼·莱马克里斯·e·珊< seshanv mskcc.org >

从内部引用(R,回车引用(“DNAcopy”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 DNAcopy
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation,微阵列,软件
版本 1.50.1
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 12.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 CGHcall,cghMCR,单克隆,CRImage,PureCN,snapCGH
进口我 ADaCGH2,AneuFinder,ArrayTV,冠军,cn.farms,CNAnorm,CNVrd2,contiBAIT,conumee,文案,GWASTools,MEDIPS,MinimumDistance,QDNAseq,rCGH,Repitools,snapCGH
建议我 beadarraySNP,cn.mops,fastseg,genoset
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 DNAcopy_1.50.1.tar.gz
Windows二进制 DNAcopy_1.50.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) DNAcopy_1.50.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAcopy
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DNAcopy/
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