安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“DNAcopy”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
实现了循环二进制分割(CBS)算法来段DNA拷贝数数据和识别基因组拷贝数异常的地区。
作者:万卡特拉曼·莱马克里斯·e·珊,亚当Olshen
维修工:万卡特拉曼·莱马克里斯·e·珊< seshanv mskcc.org >
从内部引用(R,回车引用(“DNAcopy”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“DNAcopy”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DNAcopy”)
R脚本 | DNAcopy | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,微阵列,软件 |
版本 | 1.50.1 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 12.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | CGHcall,cghMCR,单克隆,CRImage,PureCN,snapCGH |
进口我 | ADaCGH2,AneuFinder,ArrayTV,冠军,cn.farms,CNAnorm,CNVrd2,contiBAIT,conumee,文案,GWASTools,MEDIPS,MinimumDistance,QDNAseq,rCGH,Repitools,snapCGH |
建议我 | beadarraySNP,cn.mops,fastseg,genoset |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | DNAcopy_1.50.1.tar.gz |
Windows二进制 | DNAcopy_1.50.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | DNAcopy_1.50.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAcopy |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DNAcopy/ |
包下载报告 | 下载数据 |