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女性

doi:10.18129/b9.bioc.fem

识别功能性表观遗传模块

生物导体版本:版本(3.5)

FEM软件包对DNA甲基化和基因表达数据进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块,这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息,请参见Jiao等人的生物信息学2014。

作者:Andrew E. Teschendorff和Zhen Yang

维护者:Zhen Yang

引用(从r内,输入引用(“ fem”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ fem”)

PDF R脚本 FEM软件包对DNA甲基化和基因表达进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块,这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息,请参见Jiao等人的生物信息学2014。
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,差甲基化,,,,NetworkEnrichment,,,,软件,,,,系统生物学
版本 3.4.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3年)
执照 GPL(> = 2)
要看 AnnotationDbi,,,,矩阵,,,,Marray,,,,Corrplot,,,,Igraph,,,,,,,,林玛,,,,org.hs.eg.db,,,,图形,,,,生物基因
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源包 fem_3.4.0.tar.gz
Windows二进制 fem_3.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) FEM_3.4.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fem
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/fem/
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