要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGlincs”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
通过从KGML文件中获得的信息显式地重新创建路径映射,了解KEGG路径的“底层”发生了什么。
作者:莎娜·怀特
维护者:Shana White
引文(从R内,输入引用(“KEGGlincs”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGlincs”)
超文本标记语言 | R脚本 | KEGGlincs工作流 |
超文本标记语言 | R脚本 | KEGGlincs工作流 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBiology,DataRepresentation,GeneExpression,GraphAndNetwork,KEGG,网络,NetworkInference,通路,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.3),KOdata,hgu133a.db,org.Hs.eg.db(> = 3.3.0) |
进口 | AnnotationDbi,KEGGgraph,igraph,plyr,gtools,httr,RJSONIO,KEGGREST,方法,图形,统计,utils,XML |
链接 | |
建议 | BiocInstaller(> = 1.20.3),knitr,图 |
SystemRequirements | 细胞景观(>= 3.3.0),Java (>= 8) |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | KEGGlincs_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | KEGGlincs_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | KEGGlincs_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/KEGGlincs/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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