要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGlincs”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

KEGGlincs

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGlincs

可视化KEGG路径中的所有边并覆盖LINCS数据[选项]

Bioconductor版本:Release (3.5)

通过从KGML文件中获得的信息显式地重新创建路径映射,了解KEGG路径的“底层”发生了什么。

作者:莎娜·怀特

维护者:Shana White , Mario Medvedovic

引文(从R内,输入引用(“KEGGlincs”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGlincs”)

文档

超文本标记语言 R脚本 KEGGlincs工作流
超文本标记语言 R脚本 KEGGlincs工作流
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBiologyDataRepresentationGeneExpressionGraphAndNetworkKEGG网络NetworkInference通路软件ThirdPartyClient
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3),KOdatahgu133a.dborg.Hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口 AnnotationDbiKEGGgraphigraphplyrgtoolshttrRJSONIOKEGGREST,方法,图形,统计,utils,XML
链接
建议 BiocInstaller(> = 1.20.3),knitr
SystemRequirements 细胞景观(>= 3.3.0),Java (>= 8)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 KEGGlincs_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 KEGGlincs_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) KEGGlincs_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/KEGGlincs/
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