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NetPathminer
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doi：10.18129/b9.bioc.netpathminer
NetPathminer用于生物网络建设，路径挖掘和可视化
生物导体版本：版本（3.5）
NetPathminer是使用基因组规模网络进行网络路径挖掘的一般框架。它从KGML，SBML和Biopax文件构建网络，提供三个网络表示，代谢，反应和基因表示。NetPathminer找到了活动路径并应用机器学习方法来总结发现的路径以简化解释。它还提供了网络和途径的静态和交互式可视化，以帮助手动调查。
作者：艾哈迈德·穆罕默德（Ahmed Mohamed）<穆罕默德（kuicr.kyoto-u.ac.jp>），蒂姆·汉考克（Tim Hancock>，尼古拉斯·威克（Nicolas Wicker）<尼古拉斯（Nicolas）。
维护者：艾哈迈德·穆罕默德（Ahmed Mohamed
引用（从r内，输入引用（“ NetPathminer”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ NetPathminer”）
| R脚本 | NetPathminer小插图 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，聚类，，，，GraphandNetwork，，，，网络，，，，途径，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（3。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0.2），Igraph（> = 1.0） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | rbiopaxparser（> = 2.1），rcurl，，，，图形 |
| 系统要求 | libxml2，libsbml（> = 5.5） |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ahmohamed/netpathminer |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | NetPathminer_1.12.1.tar.gz |
| Windows二进制 | NetPathminer_1.12.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | NetPathminer_1.12.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netpathminer |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/netpathminer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
