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DOI:10.18129 / B9.bioc.Rsubread

R的子读序列比对

Bioconductor版本:Release (3.5)

提供强大和易于使用的工具分析下一代测序读取数据。包括序列读取质量评估、读比对、读摘要、外显子-外显子连接检测、融合检测、长、短索引检测、绝对表达调用和SNP调用。可与任何主要测序平台生成的reads一起使用，包括Illumina GA/HiSeq/MiSeq, Roche GS-FLX, ABI SOLiD和LifeTech Ion PGM/质子测序仪。

作者:石伟、廖阳，作者:Gordon Smyth、Jenny Dai、Timothy Triche, Jr.

维护者:Wei Shi < Shi at wehi.edu.au>

安装

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文档

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PDF	R脚本	Rsubread装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，ChIPSeq，GeneExpression，GeneRegulation，GeneticVariability，遗传学，GenomeAnnotation，预处理，质量控制，RNASeq，单核苷酸多态性，SequenceMatching，测序，软件
版本	1.26.1
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/Rsubread.html
全靠我	samExploreR
进口我	dupRadar
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Rsubread_1.26.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Rsubread_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rsubread
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Rsubread/
软件包下载报告	下载数据