要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SPLINTER”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

文本的拼接解释器

Bioconductor版本:Release (3.5)

SPLINTER提供工具来分析可选剪接位点,根据序列信息解释结果,选择和设计引物进行位点验证,并给出事件的可视化表示来指导下游实验。

作者:Diana Low

维护者:Diana Low

引文(从R内,输入引用(“分裂”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SPLINTER”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF R脚本 分裂
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingGeneExpressionRNASeq软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.3.0), grDevices, stats
进口 图形,ggplot2seqLogoBiostringsbiomaRtGenomicAlignmentsGenomicRangesGenomicFeaturesGvizIRangesS4VectorsGenomeInfoDb跑龙套,plyrBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 SPLINTER_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 SPLINTER_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SPLINTER_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SPLINTER/
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