- 家
- Bioconductor 3.5
- 软件包
- STRINGdb
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“STRINGdb”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
STRINGdb
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.STRINGdb
STRINGdb(蛋白质相互作用数据库的检索搜索工具)
Bioconductor版本:版本(3.5)
STRINGdb包提供了一个R界面到字符串蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)。
作者:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini在isb-sib.ch >
维护人员:亚历山大·罗斯<亚历山大。罗斯在isb-sib.ch >
从内部引用(R,回车引用(“STRINGdb”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“STRINGdb”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“STRINGdb”)
| R脚本 | STRINGdb装饰图案 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 网络,软件 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(4年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.14.0) |
| 进口 | png,sqldf,plyr,igraph,RCurl、方法、RColorBrewer,gplots,哈希,plotrix |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | PPInfer,scsR |
| 进口我 | pwOmics,日坛 |
| 建议我 | epiNEM,GeneNetworkBuilder,PCAN |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | STRINGdb_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | STRINGdb_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | STRINGdb_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STRINGdb |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/STRINGdb/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
