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DOI:10.18129 / B9.bioc.Streamer

启用大文件的流处理

Bioconductor版本:Release (3.5)

在R中处理大数据文件可能很困难，因为R中的数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一种编程风格，即数据通过“生产者”和一系列“消费者”从磁盘“流”到R，通常将原始数据减少到可管理的大小。该包为数据输入、采样、索引和转换等操作提供了有用的生产者和消费者流组件;看到包吗?彩带for details.

作者:Martin Morgan, Nishant Gopalakrishnan

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“Streamer”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“流光”)

PDF	R脚本	Streamer:一个简单的例子
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,图，RBGL平行,BiocGenerics
链接
建议	RUnit，Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments，Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	plethy
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Streamer_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	Streamer_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Streamer_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Streamer/
软件包下载报告	下载数据