# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“TCGAbiolinksGUI”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.TCGAbiolinksGUI

“TCGAbiolinksGUI:图形用户界面分析癌症的分子和临床数据”

Bioconductor版本:版本(3.5)

“TCGAbiolinksGUI:一个图形用户界面,分析癌症分子和临床资料。一个演示版本的GUI在https://tcgabiolinksgui.shinyapps.io/tcgabiolinks/”

作者:蒂亚戈席尔瓦Chedraoui < tiagochst gmail.com >,安东尼奥Colaprico <安东尼奥。colaprico ulb.ac。>,< Catharina奥尔森colsen ulb.ac。>,米歇尔,切蒋禄卡波特米< gbonte ulb.ac。>,本杰明·p·伯曼<本杰明。伯曼在cshs.org >, Houtan Noushmehr < houtana gmail.com >

维护者:蒂亚戈。席尔瓦< tiagochst gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“TCGAbiolinksGUI”)

文档

HTML	R脚本	1。介绍
HTML	R脚本	2。数据菜单
HTML		3所示。分析菜单
HTML		4所示。Integratice分析菜单
HTML		5。案例研究
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,DNASeq,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,GUI,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,MethylationArray,网络,通路,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.3.1),shinydashboard(> = 0.5.3)
进口	闪亮的(> = 0.14.1),下载器(> = 0.4)、网格情节,readr,stringr(> = 1.1.0),SummarizedExperiment,ggrepel,data.table,shinyFiles(> = 0.6.2),ggplot2(> =魅惑,pathview,埃尔默(> = 1.2.1),clusterProfiler平行,TCGAbiolinks(> = 2.2.4)shinyjs(> = 0.7),colourpicker,shinyBS(> = 0.61)
链接
建议	testthat,knitr,roxygen2,devtools,房车,xml2,BiocStyle,动画,老鸨
SystemRequirements
增强了
URL
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进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	TCGAbiolinksGUI_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	TCGAbiolinksGUI_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	TCGAbiolinksGUI_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCGAbiolinksGUI
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TCGAbiolinksGUI/
包下载报告	下载数据