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- Bioconductor 3.5
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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“YAPSA”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
YAPSA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.YAPSA
另一个包进行签名分析
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包提供了函数和例程有用的分析体细胞签名(cf。l . Alexandrov et al ., 2013)。特别是函数进行特征分析与已知签名(LCD =线性组合分解)和签名分析分层突变目录(SMC =分层突变目录)。
作者:丹尼尔·Huebschmann Zuguang顾,马提亚Schlesner
维护人员:丹尼尔Huebschmann < Huebschmann。丹尼尔:googlemail.com >
从内部引用(R,回车引用(“YAPSA”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“YAPSA”)
文档
| HTML | R脚本 | YAPSA |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiologicalQuestion,聚类,DNASeq,GenomicVariation,测序,软件,SomaticMutation,StatisticalMethod,可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),GenomicRanges,ggplot2、网格 |
| 进口 | lsei,SomaticSignatures,VariantAnnotation,GenomeInfoDb,reshape2,gridExtra,corrplot,dendextend,GetoptLong,circlize,gtrellis,PMCMR,ComplexHeatmap,KEGGREST,grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | YAPSA_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | YAPSA_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | YAPSA_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/YAPSA |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/YAPSA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
