##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite

来自路径拓扑环境的GRAPH交互作用

Bioconductor版本:Release (3.5)

从Biocarta, HumanCyc, KEGG, NCI, Panther, Reactome和SPIKE数据库中导出的路径拓扑图对象。

作者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元,Enrica Calura , Chiara Romualdi

维护者:Gabriele Sales < Gabriele。unipd.it的销售额为100亿美元

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“石墨”)

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(石墨)

PDF	R脚本	来自路径拓扑环境的GRAPH交互作用
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BioCarta,GraphAndNetwork,KEGG,网络,通路,Reactome,软件,ThirdPartyClient
版本	1.22.0
在Bioconductor中	BioC 2.9 (R-2.14)(6年)
许可证	AGPL-3
取决于	R(>= 2.10)，方法
进口	AnnotationDbi,图，统计，utils，rappdirs
链接
建议	BiocStyle,hgu133plus2.db,org.Hs.eg.db,SPIA(> = 2.2),topologyGSA(> = 1.4.0),限幅器,所有,testthat
SystemRequirements
增强了	DEGraph,RCytoscape,RCy3
URL
这取决于我	ToPASeq
进口我	facopy,mogsa,ReactomePA
建议我	限幅器
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	graphite_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	graphite_1.21.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	graphite_1.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/graphite/
软件包下载报告	下载数据