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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“gtrellis”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
gtrellis
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DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis
基因组水平框架布局
Bioconductor版本:版本(3.5)
基因组水平格子图可视化基因数据受制于基因类别(如染色体)。对于每个基因组的类别,多个维度数据被表示为跟踪描述从不同的方面不同的特性。这个包提供高灵活性安排基因类别和添加自定义图形的阴谋。
作者:Zuguang顾
维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“gtrellis”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“gtrellis”)
文档
| HTML | R脚本 | 使基因组水平格子图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 测序,软件,可视化 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.1.2)、网格IRanges,GenomicRanges |
| 进口 | circlize(> = 0.3.3),GetoptLong、grDevices跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat(> = 1.0.0),knitr,RColorBrewer,减价,ComplexHeatmap(> = 1.9.7),开罗,png,jpeg,tiff |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/jokergoo/gtrellis |
| 取决于我 | |
| 进口我 | YAPSA |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | gtrellis_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gtrellis_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | gtrellis_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/gtrellis/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
