要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ metavizr”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
该软件包为Metaviz Web应用程序(http://metaviz.cbcb.umd.edu)提供了WebSocket通信,以进行元基因组学数据的交互式可视化。R/Bioc交互式会话中的对象可以在图中显示,可以使用acketzoom可视化探索数据。支持基本的生物导体数据结构(例如,mrexperiment对象),同时提供了一种简单的机制来支持其他数据结构。可视化(使用d3.js)也可以轻松地添加到Web应用程序中。
作者:Hector Corrada Bravo [CRE,AUT],Florin Chelaru [AUT],Justin Wagner [AUT],Jayaram Kancherla [aut],Joseph Paulson [aut]
维护者:hector Corrada bravo
引用(从r内,输入引用(“ metavizr”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ metavizr”)
html | R脚本 | Metavizr简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | GUI,,,,基础设施,,,,宏基因组学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.0.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(0.5岁) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | r(> = 3.3),元基因组(> = 1.17.1),方法,Data.Table,,,,生物酶,,,,消化 |
进口 | epivizr,,,,epivizrdata,,,,Epivizrserver,,,,EPIVIZRSTANTALLONE,,,,素食主义者,,,,GenomeInfodB,,,,门索,,,,httr |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,矩阵,,,,MSD16S(> = 0.109.1),ETEC16S,,,,测试,,,,GSS |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | metavizr_1.0.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | metavizr_1.0.2.2.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | metavizr_1.0.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavizr |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/metavizr/ |
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