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DOI:10.18129 / B9.bioc.mmnet

此包适用于Bioconductor 3.5版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见mmnet．

系统生物学的宏基因组管道

Bioconductor版本:Release (3.5)

该软件包给出了微生物代谢网络的构建和分析的实现方法。它介绍了一种独特的宏基因组系统生物学方法，将宏基因组数据映射到KEGG全球代谢途径，并构建了一个系统级网络。系统级网络和接下来的拓扑分析将有助于分析宏基因组的各种功能特性，包括调控和代谢功能。

作者:曹阳，李飞

维护者:曹阳< yiluheiheiat gmail.com>，李飞

安装

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文档

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browseVignettes(“mmnet”)

PDF	R脚本	mmnet
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphsAndNetwork，微生物组，通路，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.13.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.14)，igraph, biom
进口	Biobase，RJSONIO，stringr，reshape2，ggplot2，KEGGREST，plyr，XML，RCurl，flexmix，矩阵、方法、工具
链接
建议	RCytoscape，图，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	mmnet_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mmnet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mmnet/
软件包下载报告	下载数据