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mvGST

DOI:10.18129 / B9.bioc.mvGST

多元和定向基因测试

Bioconductor版本:版本(3.5)

mvGST提供独立于平台的工具来识别项(基因集),不同活跃(向上或向下)在多个感兴趣的对比。给定矩阵的片面的假定值(行基因,列对比),mvGST使用整合方法结合假定值对所有基因注释每个基因集,然后每个基因集划分为(1)更活跃,不活跃(1),或不显著差异活动(0)在每个感兴趣的对比。与多个感兴趣的对比,每个基因集分配给一个概要文件(在对比)的微分活动。工具也提供了可视化(图形)基因分类设置为给定的概要文件。

作者:约翰·r·史蒂文斯和丹尼斯·s·Mecham

维修工:约翰·r·史蒂文斯< john.r。史蒂文斯在usu.edu >

从内部引用(R,回车引用(“mvGST”)):

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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,OneChannel,通路,RNASeq,软件
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10.0),GO.db,Rgraphviz
进口 gProfileR,stringr,topGO,GOstats,注释,AnnotationDbi,
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包档案

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源包 mvGST_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 mvGST_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) mvGST_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mvGST
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/mvGST/
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