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DOI:10.18129 / B9.bioc.pbcmc

基于排列的分子分类置信度研究

Bioconductor版本:Release (3.5)

pbcmc包描述了基于排列测试的基因表达分类器(即分子标记)的不确定性评估。为了实现这一目标，通过排列基因标签获得合成模拟对象。然后，将每个合成主题与相应的子类型分类器进行测试，以构建空分布。因此，可以为每个受试者提供分类置信度测量，以协助医生选择治疗方法。目前，它只适用于PAM50的genefu包，但它可以很容易地扩展到其他分子标记。

作者:Cristobal Fresno, German A. Gonzalez, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:Cristobal Fresno

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文档

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PDF	R脚本	基于排列的分子类置信度
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，KEGG，微阵列，MultipleComparison，归一化，OneChannel，质量控制，RNASeq，软件，TwoChannel，mRNAMicroarray
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.4)，genefu
进口	Biobase，BiocGenerics，BiocParallel(>= 1.3.13)，平行，reshape2，网格，utils，cowplot、方法、limma，ggplot2，gridExtra， grDevices, stats
链接
建议	breastCancerUPP，breastCancerNKI，breastCancerVDX，breastCancerTRANSBIG，breastCancerMAINZ，breastCancerUNT
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar/
全靠我
进口我
建议我	MIGSA
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	pbcmc_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	pbcmc_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pbcmc_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbcmc
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pbcmc/
软件包下载报告	下载数据