要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("qpgraph")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

qpgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph

从高通量基因组学数据估计遗传和分子调控网络

Bioconductor版本:Release (3.5)

从高通量表达和基因分型分析中估计基因和eQTL网络。

作者:Robert Castelo [aut, cre], Alberto Roverato [aut]

维护者:Robert Castelo < Robert。卡斯特罗访问upf.edu>

引用(从R中,输入引用(“qpgraph”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("qpgraph")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“qpgraph”)

PDF BasicUsersGuide.pdf
PDF R脚本 使用qpgraph估计eQTL网络
PDF R脚本 利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程
PDF R脚本 用qpgraph模拟分子调控网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneRegulationGeneticVariability遗传学GraphAndNetwork微阵列NetworkInference通路单核苷酸多态性软件转录
版本 2.10.2
在Bioconductor公司 BioC 2.4 (R-2.9)(8.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.0.0)
进口 方法、并行矩阵(>= 1.0), grid,注释(> = 1.45.1),BiobaseS4VectorsBiocParallelAnnotationDbiIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesGenomicFeaturesmvtnormqtlRgraphviz
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStylegenefilterorg.EcK12.eg.dbrlecuyer类别GOstats
SystemRequirements
增强了
URL http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph
全靠我
进口我 限幅器ToPASeq
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 qpgraph_2.10.2.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_2.10.2.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) qpgraph_2.10.2.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/qpgraph/
软件包下载报告 下载数据

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