要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ rbiopaxparser”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
解析Biopax文件并在R中代表它们,目前支持Biopax级别2和3级。
作者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)
维护者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)
引用(从r内,输入引用(“ rbiopaxparser”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ rbiopaxparser”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rbiopaxparser”)
R脚本 | rbiopaxparser小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,软件 |
版本 | 2.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(4。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.0.0),Data.Table |
进口 | XML |
链接 | |
建议 | rgraphviz,,,,rcurl,,,,图形,,,,运行,,,,生物基因,,,,NEM,,,,rbgl,,,,Igraph |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/frankkramer-lab/rbiopaxparser |
取决于我 | |
进口我 | AnnotationHubdata,,,,杂种 |
建议我 | AnnotationHub,,,,NetPathminer |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rbiopaxparser_2.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | rbiopaxparser_2.16.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rbiopaxparser_2.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rbiopaxparser |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rbiopaxparser/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |