要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("rTRM")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

rTRM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTRM

从PPI网络中识别转录调控模块

Bioconductor版本:Release (3.5)

rTRM识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的转录调节模块(TRMs)。

作者:迭戈Diez

维护者:Diego Diez

引用(从R中,输入引用(“rTRM”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("rTRM")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“rTRM”)

PDF R脚本 介绍rTRM
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneRegulationGraphAndNetwork网络软件转录
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10),igraph(> = 1.0)
进口 AnnotationDbiDBIRSQLite
链接
建议 RUnitBiocGenericsMotifDbPWMEnrichbiomaRtknitrBiostringsBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.maskedorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbggplot2
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports https://github.com/ddiez/rTRM/issues
取决于我
进口我 rTRMui
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 rTRM_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 rTRM_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) rTRM_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTRM
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/rTRM/
包下载报告 下载数据

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