要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

seqCNA

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqCNA

高通量测序癌症数据拷贝数分析

Bioconductor版本:Release (3.5)

高通量测序癌症数据拷贝数分析,快速总结,广泛过滤和改进归一化

作者:David Mosen-Ansorena

维护者:David Mosen-Ansorena

引文(从R内,输入引用(“seqCNA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“seqCNA”)

PDF R脚本 seqCNA
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation遗传学测序软件
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.0),很高兴(> = 2.14),doSNOW(> = 1.0.5),adehabitatLT(> = 0.3.4),seqCNA.annot(>= 0.99),方法
进口
链接
建议
SystemRequirements samtools
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 seqCNA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 seqCNA_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) seqCNA_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqCNA
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/seqCNA/
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