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DOI:10.18129 / B9.bioc.seqLogo

DNA序列比对的序列标识

Bioconductor版本:Release (3.5)

seqLogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵，并绘制相应的序列标识，如Schneider和Stephens(1990)所介绍的。

作者:奥利弗·本博姆

维护者:Oliver Bembom < Oliver。Bembom在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“seqLogo”)

PDF	R脚本	DNA序列比对的序列标识
PDF		参考手册

细节

biocViews	SequenceMatching，软件
版本	1.42.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(10.5年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	方法、网格
进口	stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	motifRG，rGADEM
进口我	感兴趣，motifRG，PWMEnrich，rGADEM，riboSeqR，spliceSites，分裂，TFBSTools
建议我	BCRANK，DiffLogo，Logolas，motifcounter，MotifDb
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqLogo_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	seqLogo_1.42.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	seqLogo_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqLogo
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/seqLogo/
软件包下载报告	下载数据