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DOI:10.18129 / B9.bioc.skewr

可视化强度由Illumina的人类甲基化450k串珠芯片产生

Bioconductor版本:Release (3.5)

skewr包是一种工具，用于可视化Illumina人类甲基化450k串珠芯片的输出，以帮助质量控制。它创建了一个由9个情节组成的面板。其中6个图表示由485,577个总探针的三个子集之一给出的甲基化强度或非甲基化强度的密度。这些子集包括i型红、i型绿和II型。其余三个分布给出了这三个子集的beta值的密度。9个图中的每一个都可选择地显示“rs”SNP探针的分布，以及与印迹基因相关的探针作为位于x轴上方的一系列“tick”标记。

作者:Ryan Putney [cre, aut]， Steven Eschrich [aut]， Anders Berglund [aut]

维护者:Ryan Putney

安装

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文档

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browseVignettes(“skewr”)

PDF	R脚本	串肉包装介绍
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.1.1)，methylumi，西瓜，mixsmsn，IlluminaHumanMethylation450kmanifest
进口	minfi，IRanges，RColorBrewer
链接
建议	GEOquery，knitr，minfiData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	skewr_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	skewr_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	skewr_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/skewr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/skewr/
软件包下载报告	下载数据