要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

智人全基因组序列(UCSC版本hg19)

Bioconductor版本:Release (3.5)

智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg19, 2009年2月)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationDataBSgenome遗传学Homo_sapiens
版本 1.4.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.33.5)
进口 BSgenome
链接
建议 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked嵌合体食典委motifRGtra利用
进口我 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedChIPCompMADSEQRareVariantVis美国广播公司REMP
建议我 AneuFinderArrayTVATACseqQCBadRegionFinderBasic4CseqBBCAnalyzerbiovizBaseChIPpeakAnnocnCRISPRseekcustomProDBDNAshapeRensembldbFDb.FANTOM4.promoters.hg19FDb.UCSC.snp135common.hg19FDb.UCSC.snp137common.hg19gcapcGenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomicRangesGenomicScoresGenVisRggbiogmapRGoogleGenomicsGUIDEseqGvizh5vcInPAS感兴趣karyoploteRMEDIPSMinimumDistance海市蜃楼motifbreakRMutationalPatternsoneChannelGUIOrganismDbiPGAqseaR453Plus1ToolboxramwasRariantrGADEMRiboProfilingRsamtoolsRSVSimrtracklayerSGSeq签名者SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37连接工具VariantAnnotationwavClusteRXtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37YAPSA

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
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