ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

利用RNA-Seq分析替代剪接

Bioconductor版本:Release (3.6)

使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。

作者:Estefania Mancini, Javier Iserte, Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz

维护:Estefania Mancini

安装

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文档

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PDF	R脚本	基于ASpli的可选拼接分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机
进口	GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,AnnotationDbi,Rsamtools,BiocStyle
链接
建议
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	ASpli_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ASpli_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据