生物导体版本:版本(3.6)
提供用于生成注释软件包及其数据库的代码。生产的包装旨在与AnnotationDBI一起使用。
作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫尔夫(Herve)页面
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“注释”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ AnnotationForge”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ AnnotationForge”)
R脚本 | 注释:为自定义注释资源创建选择接口 | |
R脚本 | 创建探针软件包 | |
R脚本 | SQLFORGE:使用标准数据库架构创建新的注释软件包的一种简单方法。 | |
html | R脚本 | 制作新生物包 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(5。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.7.0),方法,utils,生物基因(> = 0.15.10),生物酶(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14) |
进口 | DBI,,,,rsqlite,,,,XML,,,,S4VECTORS,,,,rcurl |
链接 | |
建议 | Biomart,,,,httr,,,,GenomeInfodB,,,,生物弦,,,,副词,,,,HGU95AV2.DB,,,,Human.DB0,,,,org.hs.eg.db,,,,同性恋,,,,hom.hs.inp.db,,,,go.db,,,,生物使用,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | AnnotationHubdata,,,,gghhumanmethcancerpanelv1.db,,,,gostats |
建议我 | AnnotationDbi,,,,AnnotationHub |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | AnnotationForge_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationForge_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | AnnotationForge_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotationforge |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/annotationforge/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |