ArrayExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress

访问EBI的ArrayExpress微阵列数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

Bioconductor版本:Release (3.6)

访问EBI的ArrayExpress存储库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

作者:Audrey Kauffmann, Ibrahim Emam, Michael Schubert

维护者:Ugis Sarkans < Ugis at ebi.ac.uk>

引用(来自R,输入引用(“ArrayExpress”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ArrayExpress")

文档

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browseVignettes(“ArrayExpress”)

PDF R脚本 ArrayExpress:将ArrayExpress数据集导入并转换为R对象
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport微阵列OneChannel软件TwoChannel
版本 1.38.0
在Bioconductor中 BioC 2.3 (R-2.8)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.9.0),Biobase(> =测试盒框)
进口 XML益生元limma
链接
建议 affy
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 DrugVsDisease
进口我
建议我 gCMAPWebHiiragi2013
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 ArrayExpress_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 ArrayExpress_1.38.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ArrayExpress_1.38.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ArrayExpress/
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