batchqc

doi：10.18129/b9.bioc.batchqc

批次效果质量控制软件

生物导体版本：版本（3.6）

通常在多批次或不同时间收集或处理微阵列样品。这通常会产生技术偏见，在下游分析中可能导致不正确的结果。BATCHQC是一种软件工具，可通过提供交互式诊断，可视化和统计分析来探索批处理变异影响数据的程度，从而简化批处理预处理和评估。batchQC诊断有助于确定是否需要进行批次调整，以及在进行下游分析之前应如何应用校正。此外，batchQC交互式地应用了多种常见的批处理效应方法，并且用户可以快速看到每种方法的好处。batchqc是作为闪亮的应用程序开发的。将输出组织成多个选项卡，每个选项卡都具有批处理效应分析和可视化数据的重要部分。BATCHQC界面具有以下分析组：摘要，差异表达，中值相关性，热图，圆形树状图，PCA分析，形状，战斗和SVA。

作者：Solaiapan Manimaran ，W。EvanJohnson ，bu.edu>，Heather Selby ，Claire Ruberman gmail.com>，okrah okrah okrah okrah 上，hector Corrada bravo

维护者：solaiapan manimaran

安装

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PDF	R脚本	batchqc_usage_advanced
html		batchqc_examples
html		batchqcintro
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	批处理效应，，，，差异性，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，预处理，，，，委托人，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.6.1
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（2年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.3.0）
进口	utils，rmarkDown，，，，尼特，，，，潘德，，，，GPLOTS，，，，MCMCPACK，，，，闪亮的，，，，SVA，，，，公司，，，，时刻，，，，矩阵，，，，GGVIS，，，，D3 -HeatMap，，，，RESHAPE2，，，，林玛，grdevices，图形，统计，方法，矩阵
链接
建议	测试
系统要求	Pandoc（http://pandoc.org/installing.html）用于生成Markdown文件的报告。
增强
URL	https://github.com/mani2012/batchqc
BugReports	https://github.com/mani2012/batchqc/issues
取决于我
进口我	Pathostat
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	batchqc_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	batchqc_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	batchqc_1.6.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/batchqc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/batchqc/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.6的旧源软件包	来源存档