BgeeDB

DOI:10.18129 / B9.bioc.BgeeDB

Bgee数据库注释与基因表达数据检索

Bioconductor版本:Release (3.6)

从Bgee数据库下载注释和基因表达数据包，并进行TopAnat分析:go样富集解剖术语，通过表达模式映射到基因。

作者:Andrea Komljenovic [aut, cre]， Julien Roux [aut, cre]

维护者:Julien Wollbrett < Julien。沃布雷特在unil。ch>， Julien Roux < Julien。unibas的Roux。ch>， Andrea Komljenovic < andariakomljenovic at gmail.com>， Frederic Bastian

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“BgeeDB”)

文档

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，测序，软件
版本	2.5.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.0)，topGO，tidyr
进口	data.table，RCurl，消化，方法，统计，utils，dplyr，图，Biobase
链接
建议	knitr，BiocStyle，testthat，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	psygenet2r，日坛
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BgeeDB_2.5.0.tar.gz
Windows二进制	BgeeDB_2.5.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BgeeDB_2.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BgeeDB
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BgeeDB/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档