CNPBayes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNPBayes

拷贝数多态性的贝叶斯混合模型

Bioconductor版本:Release (3.6)

批效应和拷贝数的贝叶斯分层混合模型。

作者:斯蒂芬·克里斯蒂亚诺，罗伯特·沙尔夫，雅各布·凯里

维护者:Jacob Carey

安装

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文档

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PDF	R脚本	识别拷贝数多态性
PDF	R脚本	拷贝数估计的贝叶斯混合模型的实现
PDF	R脚本	CNPBayes包概述
PDF	R脚本	CNPBayes包概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯，CopyNumberVariation，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，IRanges，GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.1),S4Vectors，matrixStats，RColorBrewer，gtools，combinat，GenomeInfoDb(>= 1.11.6)，方法BiocGenerics，图形，统计，coda，SummarizedExperiment，mclust，reshape2，ggplot2，magrittr，purrr，tidyr，dplyr，宠物猫
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，BiocCheck，质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/scristia/CNPBayes
BugReports	https://github.com/scristia/CNPBayes/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CNPBayes_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	CNPBayes_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CNPBayes_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNPBayes
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CNPBayes/
软件包下载报告	下载数据